不结球白菜俗称青菜、小白菜,栽培面积由2005年的800万亩上升到现在的2100万亩左右,已成为第三大蔬菜作物。
近日,南京农业大学园艺学院教授侯喜林团队在《园艺研究》在线发表研究论文。该团队经过十多年深入研究,揭示了不结球白菜维生素C和硫代葡葡糖苷营养物质的代谢机制,为优良性状分子设计育种奠定了坚实基础。
该研究以不结球白菜“苏州青”为材料,利用最新的测序手段,获得了396.83Mb近完整的高质量染色体级基因组,并对其功能进行注释,其ContigN50为2.83Mb。此基因组质量高于现有其他白菜基因组。
根据这一新基因组,研究发现重复序列占全基因组的比例约为53%,并且注释得到了48,158个蛋白质编码基因。比较基因组分析证实,不结球白菜经历了一个与其他十字花科物种共享的全基因组三倍化(WGT)事件,这发生在与拟南芥共享的WGD事件之后,为研究芸薹属芸薹种亚种之间分化提供重要的依据。对维生素C和硫代葡萄糖苷(GSLs)合成和代谢途径相关基因进行了鉴定和比较分析,得到了串联复制导致的基因拷贝数变异,并且GSL基因在白菜基因组中发生了高度扩张。联合转录组分析,对相关基因的表达进行了探究,揭示了不结球白菜维生素C和硫代葡葡糖苷营养物质的代谢调控机制。(来源:中国科学报 王方)
相关论文信息:https://doi.org/10.1038/s41438-020-00449-z
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