近日，西安电子科技大学计算机科学与技术学院西安市计算生物信息学重点实验室教授高琳、胡宇轩团队的一项原创性成果”在《PLOS计算生物学》上发表。

肿瘤的发生发展不仅受到癌细胞内部遗传变异（如驱动基因突变）的影响，还与肿瘤微环境中不同细胞之间的相互作用密切相关。然而，癌细胞内部遗传变异与外部细胞通讯之间如何协同作用，目前仍缺乏系统性的计算分析框架。

针对这一问题，研究团队提出了通用计算框架Driver2Comm，用于系统关联癌细胞内部的驱动基因改变与肿瘤微环境中的细胞间通讯模式。研究团队首次提出Intrinsic–Extrinsic（IE）pathway概念，将癌症驱动基因与肿瘤微环境中细胞通讯进行系统关联，从而为理解肿瘤作为复杂生态系统的运行机制提供了新的研究视角。

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Driver2Comm通过统计关联检验与频繁子图挖掘等经典数据挖掘方法，实现了驱动基因与细胞通讯模式之间的系统关联。研究团队进一步通过IE pathway可视化分析、功能富集分析以及生存分析等下游分析方法，在乳腺癌、胰腺癌、胶质母细胞瘤以及口腔鳞状细胞癌等多种癌症数据中验证了该方法识别的IE pathway在解析肿瘤生态系统行为中的潜力，并为“靶向-免疫”联合疗法研发提供了潜在线索。

论文链接：https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1013973