IMIM（Hospital del Mar Medical Research Institute）和Pompeu Fabra大学的生物信息学家使用分子模拟技术揭示了HIV病毒成熟的关键步骤，帮助人们进一步了解新生惰性病毒发展成为传染性病毒的过程，这对于病毒复制来说至关重要。该研究发表在最近一期的美国《国家科学院院刊》（
PNAS）杂志上，将有助于日后设计抗逆转录病毒的新药物。HIV病毒成熟并变得具有感染性是HIV蛋白酶的作用结果。这种蛋白就像一把剪刀，能将连在一起的多蛋白长链切开，而被切下的蛋白会形成新病毒的传染性结构。
整个HIV成熟过程中最令研究人员感兴趣的问题是，HIV蛋白酶（“蛋白剪刀”）从蛋白长链中解离出来的机制。在HIV的成熟过程中，蛋白要从多蛋白长链中剪切下来以后才能执行功能。对于HIV蛋白酶来说也是这样。研究人员采用分子模拟软件ACEMD和GPUGRID.net技术，展示了“蛋白剪刀”将自身从多蛋白链中剪切出来的过程。研究显示，HIV蛋白酶的一端（N端）会与自身活性位点结合，然后切开自身与其余蛋白链之间的化学键切开。这是整个HIV成熟过程的第一步，研究人员指出若能在成熟过程阻断HIV蛋白酶，就能够使病毒颗粒无法成熟，也就不能产生有传染性的病毒。
GPUGRID.net计算平台有些类似于一个虚拟的超级计算机，其计算能力比以CPU为基础的电脑高十倍。GPUGRID.net所提供的计算能力，在此之前只有价值数百万美元的超级计算机才能做到，这一平台为人们大大节省了研究经费。研究人员在此平台上处理了大量数据，进行了数千个计算机模拟，并最终完成了高度复杂的模拟模型。HIV病毒感染引发的艾滋病是一种免疫缺陷性疾病，目前全球有数百万人感染了艾滋病。HIV病毒直接攻击并削弱人体免疫系统，使患者的免疫系统更容易遭受攻击。这项研究利用计算机技术，展示了关键酶自我剪切并起始HIV成熟过程的机制，使人们进一步了解了HIV生命周期中的关键步骤。研究人员指出，在这项新发现的基础上，人们有望研制出新型的艾滋病治疗药物。（来源：生物通 叶予）
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