近日，记者从海南大学获悉，该校三亚南繁研究院陈飞教授团队首次构建了“分型端粒到端粒超级泛基因组”理论体系，实现了植物基因组从个体单倍型完整到群体遗传多样性全覆盖的技术跨越。相关成果发表在国际期刊《植物科学趋势》。

植物基因组研究长期受制于参考基因组的局限——传统组装难以解析着丝粒、端粒等复杂区域，且无法反映物种全面的遗传变异，从而限制了基因挖掘和育种的范围。针对这一难题，研究团队创新提出“分型端粒到端粒+超级泛基因组”双维度框架，在理论上统一了个体层面的“端粒到端粒”完整性与群体层面的遗传多样性，突破了单一参考基因组无法兼顾完整性与代表性的瓶颈。

研究团队在多种植物中验证了该体系的有效性：“端粒到端粒”组装首次实现无间隙染色体级拼接，高重复序列区域得到完整解析；超级泛基因组显著提升了结构变异捕获率与基因多样性表达能力，并证明可在超大基因组物种中实现低成本高精度组装。

陈飞表示，该框架已经在多个重要作物的遗传育种研究开展应用，揭示关键功能基因挖掘和助力作物育种。这一研究为植物基因组学提供了新的理论框架和技术标准，是植物基因组学研究里程碑式的“金标准”。

相关论文链接：https://doi.org/10.1016/j.tplants.2025.11.002