近日，东北林业大学教授陈肃研究团队联合教授汪国华研究团队完成了我国珍稀药用植物黄檗的端粒到端粒（T2T）高质量基因组组装，系统解析了其复杂的古八倍体演化历程，并首次揭示LTR反转录转座子在黄连素生物合成途径进化中的核心作用。相关成果发表在Nature Communications上。

黄檗（俗称黄柏、黄菠萝树）为芸香科黄檗属落叶乔木，原产于东亚与东北亚地区，是第三纪孑遗植物，有植物界的“活化石”之称。作为我国东北地区三大硬阔树种之一，黄檗木材质地优良、纹理美观，是高端家具制造的珍贵用材。其树皮具有清热解毒、利胆燥湿等药用功效，兼具经济价值与药用价值。然而，受长期过度采伐影响，野生黄檗资源已极为稀少，目前被列入《国家重点保护野生植物名录》及《世界自然保护联盟濒危物种红色名录》。

本工作中，研究团队构建了黄檗近T2T染色体级别基因组。该基因组大小2.92 Gb，包含39条染色体，各项组装质量指标均达到国际领先水平。该基因组的解析，不仅为我国珍稀树种种质保护与药用成分开发提供了关键分子基础，也为相关物种的遗传改良研究奠定了重要理论支撑。

比较基因组分析表明，黄檗为古八倍体物种，其形成源于约2150万至2731万年前的多次杂交事件，并最终融合了四个祖先谱系的遗传物质。研究还首次在木本植物中证实了LTR反转录转座子可推动次生代谢途径进化，通过解析CNMT基因家族扩张，为理解黄连素、黄檗碱这类特殊代谢产物的起源提供了新视角。

相关论文信息：https://doi.org/10.1038/s41467-025-66357-9