作者:高雅丽 来源:中国科学报 发布时间:2022/5/12 21:48:06
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DNA序列显示多形茶渍复合群多达100个物种

 

地衣型真菌是一类能与蓝细菌或藻类共生形成稳定有机体的特化真菌,其物种演化和分类界定仍在不断地探索中。近日,中国科学院昆明植物研究所联合美国杨百翰大学、加拿大自然博物馆的科研人员,对采自亚洲、欧洲、北美洲和南美洲的300余份多形茶渍样品开展了物种界定研究,首次从DNA层面揭示了多形茶渍复合群极其丰富的物种多样性。相关研究成果发表在《真菌杂志》的地衣型真菌物种多样性、生态和进化历史特刊。

茶渍科是地衣型真菌的第五大科,含1000余种,是地衣分类中问题最多、最为复杂的类群之一。其中,多形茶渍为世界广布种,不同材料间形态差异较大,使该种下亚种、变种和变型多达40余个。

科研人员通过自主扩增的ITS序列结合GenBank的分子序列,采用ASAP和bPTP分析方法对多形茶渍复合群进行物种划分,ASAP分析结果显示该复合群包含62-103个种级分支,bPTP的物种划分结果为73个种级分支,与ASAP的结果基本一致,这些种级分支中仅10%左右为跨洲际分布。同时科研人员对该种复合群的五基因系统发育分析显示,绝大多数ASAP获得的种级分支与多基因分析结果一致。

在此基础上,研究人员选取了美国西部的32个代表样品进行简略基因组测序,基于1209个单拷贝核基因构建的系统发育树同样支持ASAP的物种划分结果;线粒体基因组分析检测到一个基因渐渗事件,其余种级分支也与ASAP的划分结果一致。

文章对多形茶渍复合群下潜在物种的地理分布初步分析,为该类群的分类研究提供新视野,多形茶渍复合群或可作为地衣型真菌谱系生物地理和物种形成研究的模式类群。

文章链接:https://doi.org/10.3390/jof8050490

多形茶渍复合群形态特征(昆明植物所供图)

 
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