作者:张冬冬 来源:中国科学报 发布时间:2013-9-30 13:48:36
选择字号:
德科学家获五角大楼DNA分析比赛冠军

 
由生物信息学家Daniel Huson带领的团队赢得了100万美元奖金。图片来源:Mike Steel
 
由美国国防部发起的一项DNA分析挑战比预期更为困难,但是赢家已经出现。上周,国防部宣布,Huson队将会因其快速的DNA分析计算机程序获得100万美元奖金。今年早些时候,在103名参赛者中仅有3名脱颖而出进入决赛时,该比赛的设计和得分制度曾引来一些顶级竞赛者的严厉批评。
 
德国蒂宾根大学生物信息学家Daniel Huson的队伍进入了决赛,他称,他和队友对可能夺冠有“良好的感觉”。他们兴奋地发现,自己的感觉是对的。
 
这场官方名称为国防威胁降低局(DTRA)算法挑战赛的竞赛,试图寻求一个更好的方法来确认DNA样本中的组织和基因,以识别可能的生物恐怖威胁。该挑战赛对任何人都开放,参与者通过在线竞赛主持人Inno Centive提交其作品。Huson称,他享受赢得竞赛所需要的疯狂而不间断的工作:“唯一一次像这样的工作,是我在塞雷拉基因公司研究人体基因组的时候。”
 
竞赛中,参与者需要在9组基因数据中获得一个及格的准确分数。一些人表达了对DTRA模糊的得分算法的不满,觉得自己不得不开发程序来满足一些并不明确的要求。
 
事实证明,该任务过于困难,DTRA不得不延长截止日期并放松要求。这时,Huson和他的两名同事——环境生命科学工程中心生物信息学家Xie Chao和蒂宾根大学的计算机科学研究生Benjamin Buchfink——才开始组队参加比赛。
 
“得分方式十分微妙。”Huson承认,“确实有些事让人感到惊讶。”不过他表示,他的团队通过尝试许多不同的方法得以稳定发展。(张冬冬)
 
《中国科学报》 (2013-09-30 第3版 国际)
 
 打印  发E-mail给: 
    
 
以下评论只代表网友个人观点,不代表科学网观点。 
SSI ļʱ
相关新闻 相关论文

图片新闻
130公里内,“阿耳忒弥斯1号”接近月球 地下水补给显著增加青藏高原西部湖泊水量
2035年起将暂停在时钟中增加闰秒 “子午工程”二期设备完成系统集成
>>更多
 
一周新闻排行 一周新闻评论排行
 
编辑部推荐博文
 
论坛推荐