作者:玉菡 来源:中国科学报 发布时间:2013-7-30 9:58:59
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美科学家抨击新设DNA奖项

 
近日,争夺美国国防部的DNA分析挑战赛100万美元大奖的科学家表示强烈抗议。数位排名前10位的竞争者指责利用国防威胁降低局(DTRA)的算法规则和评分标准,来检测生物恐怖威胁的DNA样本,结果含糊不清。提交期7月14日截止,103个“解决方案中”的3个——包括个人和团队——将参加最后的角逐,现在他们的计算机程序将在最后一轮评价中等待最终得分。
 
“他们组织竞争的方式和评分方式都非常令人难以接受。”英国伦敦帝国理工学院生物信息学博士生David Ainsworth说,他的团队仍在为争取奖金而努力。
 
组织者承认这项比赛非常艰难,称要算出在哪里设置障碍非常棘手。“我们不想将门槛设置得太高,而导致没有人能赢得比赛;但也不想将门槛设置得很低,让200人都能并列第一。”该挑战项目负责人Christian Whitchurch说。事实上,三个团队的成功已经让他乐观地认为,最终的产物将广泛地应用于政府部门。
 
但是一些参与者说,评分系统不必那么复杂,也没能反映出他们的工作质量。“根据我所理解的比赛目标,我认为让最好的算法胜出是不可能的。”美国马里兰州巴尔的摩市约翰斯·霍普金斯大学生物信息学家Steven Salzberg说。他没有参与这项比赛,但他实验室的两名科学家—— 一个博士生和一个生物信息学工程师——未进入决赛。
 
今年1月,DTRA设置了该挑战赛,以期尽快找到一种更快、更准确的方式在原始DNA基础上识别物种和基因的技术。因为DNA测序技术越来越快捷、便宜,DTRA希望挑战会激发一个高度精确的程序的诞生,以便在1小时内检测出具有潜在危险的DNA样本——这将是对人类现有能力的一个巨大提升。(玉菡)
 
《中国科学报》 (2013-07-30 第3版 国际)
 
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