作者:Eric E. Schadt 来源:《自然—遗传学》 发布时间:2012-5-7 16:44:56
选择字号:
新技术可从RNA中读取DNA信息
 
来自美国西奈山医学院的研究人员近日来发了一种可从非DNA资源例如RNA中获取足量DNA信息的新方法,可清楚鉴别出储存在大型研究数据库中的个体生物学信息。相关研究论文发表在4月8日的《自然—遗传学》(Nature Genetics)杂志上。
 
DNA中包含着每个活细胞发育和功能所需的遗传指令。RNA充当信使在细胞中传递遗传信使,确保组织正常功能所需的大多数细胞过程能够被执行。
 
由于长期以来被视作是个体唯一的遗传指纹,迄今为止访问DNA信息数据库仍受到限制和保护。然而目前有大量的RNA数据却通过美国和欧洲的多个数据库对公众开放。这些数据库包含着来自世界各地成千上万基因组研究的数据。
 
在新研究中,西奈山医学院基因与多尺度生物学研究所主任、遗传学和基因组学系主任、基因组学教授Eric E. Schadt和西奈山医学院遗传学副教授Ke Hao博士开发出了一项新技术,借助于这项技术可以从RNA数据中推断出个人的DNA信息。当前大部分的DNA和RNA研究都是以DNA序列为起点,寻找群体中个体间表达模式与DNA改变之间的关联。新研究是首次从RNA水平来描述DNA序列。
 
在这篇文章中,Schadt、Ke Hao以及华盛顿大学生物统计学系的Sangsoon Woo博士对来自378名欧美捐赠者的肝脏的RNA和DNA,以及来自同一群体580名接受胃分流术者的肝脏和脂肪组织的RNA和DNA进行了分析。作者发现多个基因的RNA水平与年龄、性别、体重和诸如糖尿病、心脏病等疾病的其他风险因子相关,此外,它们还与许多情况下个体独特的DNA改变相关。
 
研究人员采用一种算法将基因表达模式与基因组中1000个单DNA碱基位点的变异对应起来。这是首次运用整合生物学检测多层面的DNA和RNA数据由此更好地了解RNA的指定层面。
 
Schadt 说:“DNA与RNA的关系就像是一组管弦乐队和它正在演奏的乐曲。DNA(管弦乐队)不发生改变,然而RNA的表达方式(乐曲品质)却对应外界因素发生改变。新技术通过聆听乐曲,推导出在管弦乐队中有哪种乐器,通过样本追溯RNA和调控的基因来解析发育的过程。”
 
Schadt 说:“通过观测特定组织中的RNA水平,我们可以推断出标记个体的独特基因型条码,通过这种途径将个体与获得的DNA样本对应起来。这一信息的潜在用途具有重要意义:不仅可以从RNA中推论出基因型条码,且还可根据某些组织的RNA水平来了解个体如年龄、性别以及疾病的特征,以及阿尔茨海默氏症和癌症等疾病的发病风险。”(来源:生物通 何嫱)
 
 
 
 
特别声明:本文转载仅仅是出于传播信息的需要,并不意味着代表本网站观点或证实其内容的真实性;如其他媒体、网站或个人从本网站转载使用,须保留本网站注明的“来源”,并自负版权等法律责任;作者如果不希望被转载或者联系转载稿费等事宜,请与我们接洽。
 
 
 打印  发E-mail给: 
    
 
以下评论只代表网友个人观点,不代表科学网观点。
SSI ļʱ
 
相关新闻 相关论文

图片新闻
3个国家级杜鹃花新品种获授权 应对全球自然衰退亟需“安全网”
判断河流干旱与否,请看海洋 月亮上的水比我们想象中多
>>更多
 
一周新闻排行 一周新闻评论排行
 
编辑部推荐博文
 
论坛推荐