作者:傅金钟等 来源:《BMC基因组学》 发布时间:2012-11-12 15:49:00
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推动两栖动物适应高海拔环境候选基因被发现

 成都生物所等发现推动两栖动物适应高海拔环境的候选基因
 
寻找生物适应高海拔环境的遗传机制是近年来生命科学领域研究热点之一,然而已有大部分研究都是针对恒温动物,对于变温动物适应高海拔环境的遗传机制还很不清楚。与恒温动物相比,变温动物在生理和行为特征上都有诸多不同,这也暗示了它们在进化过程中可能有独特的适应高海拔环境的机制。  
 
为了探寻这一个问题,中科院成都生物研究所傅金钟课题组与美国加州大学伯克利分校Ke Bi博士合作,以青藏高原东缘的一对姐妹物种——低海拔的中国林蛙(Rana chensinensis)和高海拔的高原林蛙(Rana kukunoris)为研究对象,通过高通量的RNA-seq测序技术以及生物信息学的分析方法,组装并获得了7000对以上的直系同源(orthologous)基因,发现这些基因中有450个带有正选择标记(positive signature),并通过功能推断得到了14个可能与高原林蛙适应高海拔环境相关的候选基因,这些基因大多与抗紫外、抗低氧和新陈代谢调节等功能相关。
 
有趣的是,与恒温动物相比,高原林蛙CYP家族的基因同样经历了正选择,这暗示着恒温动物与冷血动物在氧结合(oxygen binding)功能上的趋同进化。以上研究结果,为进一步研究变温动物适应高海拔环境的遗传机制打下了基础。
 
该研究结果已于近期发表在基因组学刊物BMC Genomics上。 (来源:中科院成都生物研究所)
 
 
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