作者:任芳言 来源:科学网微信公号 发布时间:2020/1/24 14:10:54
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新型肺炎“元凶”更可能是蝙蝠而非蛇

 

导读:

来自科院武汉病毒所石正丽等人的研究显示,新型冠状病毒与一种蝙蝠冠状病毒有96.2%的一致性。

这与此前宿主可能是蛇的研究观点不同。

同时,在Nature新发报道中,不止一位研究者指出:蛇可能不是病毒传播者。

 

截至1月23日24时,国家卫健委收到29个省份累计报告新型肺炎确诊病例830例,死亡25例。

1月23日晚,中国疾病预防控制中心主任、科院院士高福接受央视“新闻1+1”采访时指出,通过环境样本检测,工作人员已在武汉华南海鲜市场获取到病毒基因组并从中分离出病毒,病源来自野生动物的证据确凿。

同一天,科院武汉病毒所研究员石正丽等人在预印本网站BioRxiv上发布研究。

研究者从疫情早期的5位患者处提取了新型冠状病毒nCoV-2019的全基因组序列,并发现这些序列间几乎完全相同,且与SARS冠状病毒有79.5%的一致性。

此外,石正丽等人还发现,与此前在云南中菊头蝠上检测到的蝙蝠冠状病毒RaTG13相比较,nCoV-2019在整个基因组中与其有96.2%的一致性。

系统发育分析显示,RaTG13与nCoV-2019有非常近的亲缘关系,与其他SARSr-CoVs形成明显世系,有相对独立的分支。

基于nCoV-2019WIV04的全长基因组序列相似性图。SARS-CoV BJ01,蝙蝠SARSr-CoV WIV1,蝙蝠冠状病毒RaTG13和ZC45的全长基因组序列用作参考序列。(图片来源:BioRxiv)

石正丽等人还对病毒细胞受体进行分析,发现SARS冠状病毒的细胞受体——血管紧张素转化酶II (ACE2)也可能是nCoV-2019的细胞受体。

在Nature 23日发布的报道中,科院上海巴斯德研究所研究员崔杰指出:nCoV-2019是一种哺乳动物病毒,哺乳动物最有可能成为病毒传播者。2017年,他曾与石正丽等人合作展开SARS研究,在云南找到了相关病毒。

这与来自另一团队发表的研究相印证。

1月21日,科院上海巴斯德研究所研究员郝沛与军事医学研究院研究员钟武、科院分子植物卓越中心研究员李轩等人发布的研究显示:nCoV-2019和SARS都是病毒亚组β冠状病毒的一部分,可寄生和感染高等动物,两种病毒的共同祖先与病毒HKU9-1类似。

研究团队推测,nCoV-2019自然宿主为蝙蝠。

也有研究者指出,病毒宿主可能是蛇。

1月22日,来自北大医学院的姬伟和来自广西中医药大学、宁波大学、武汉生物工程学院的合作者在线发表研究。

病毒产生适应性的方式之一是与宿主使用相同的密码子以编码蛋白质,该团队将nCoV-2019与刺猬、穿山甲、蝙蝠、蛇等潜在宿主偏好的密码子进行比较,发现nCoV-2019偏好的密码子与银环蛇、中华眼镜蛇两种动物偏好的密码子最相似。由此推论蛇是最有可能的野生动物传染源。

但英国格拉斯哥大学的病毒学家大卫·罗伯森(David Robertson)在回应Nature时指出,目前没有证据表明爆发后的病毒可以感染哺乳动物和鸟类之外的其他物种,“没有证据表明蛇牵涉在其中。”

罗伯森还指出,nCoV-2019感染次要动物宿主的时间不够长,不足以让病毒基因组发生显著改变。“这样的过程需要很长时间”,他表示。

巴西圣保罗大学的病毒学家保罗·爱德华多·布兰迪奥(Paulo Eduardo Brandão)也在研究蛇是否会感染冠状病毒,他表示,目前还没有证据表明蛇被新型冠状病毒感染病成为宿主。“除了哺乳动物和鸟类以外,没有一致证据表明其他宿主体内存在冠状病毒。”

前述研究作者之一、武汉生物工程学院病毒载体(基因治疗)湖北省工程技术研究中心研究员李兴广在接受媒体采访时表示:

我们推断蛇是武汉肺炎病毒最有可能的野生动物宿主。但是,我们需要再一次特别强调的是,这不是最终的结论。至于武汉肺炎病毒真正的野生动物来源宿主的确切结果,仍需要全体相关科研人员的继续努力。但是,我们结果至少提出了一种可能性,供其他科研人员和公众参考。

参考资料

卫健委数据:http://www.nhc.gov.cn/xcs/yqfkdt/202001/c5da49c4c5bf4bcfb320ec2036480627.shtml

高福接受1+1采访:http://tv.cctv.com/live/cctv13/index.shtml?spm=C28340.P2qo7O8Q1Led.S87602.99&stime=1579786200&etime=1579788000&type=lbacks

石正丽团队论文:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.01.22.914952v1

郝沛团队论文:http://engine.scichina.com/publisher/scp/journal/SCLS/doi/10.1007/s11427-020-1637-5?slug=fulltext

姬伟等人论文:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/jmv.25682

Nature报道:https://www.nature.com/articles/d41586-020-00180-8

李兴广接受《楚天都市报》采访:https://baijiahao.baidu.com/s?id=1656544757469510194&wfr=spider&for=pc

 
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