来源:Genes 发布时间:2021/9/18 18:06:47
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MDPI Genes | 2020年封面文章精选 (上)

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Genes 编辑部荟萃2020年封面文章,与读者分享最新领域的研究进展。本期内容共有6期封面文章荐读,主题涉及使用16S rDNA纳米孔测序对细菌种群进行离地鉴定的研究、孔雀鱼在瀑布上方的流变研究、DNA解旋酶的历史综述、花对称性的分子基础研究、遗传多样性和群体结构研究、用于工程小鼠的CRISPR指导和捐助者的快速评估研究,希望为相关领域的学者提供新的思路和参考。

01. Earth Identification of Bacterial Populations Using 16S rDNA Nanopore Sequencing

使用16S rDNA纳米孔测序对地球外细菌种群进行鉴定

Aaron S. Burton et al.

DOI:10.3390/genes11010076

封面故事:宇航员Peggy Whitson博士将国际空间站(ISS)的维护工作区 (MWA,蓝色表面) 变成了一个研究工作台。在miniPCR (Amplyus)和MinION (Oxford Nanopore Technologies) 的支持下,Whitson准备并测序了从从国际空间站收集并培养的细菌中的DNA。将用于细菌培养的琼脂玻片返回地面进行了标准实验室处理和鉴定。在国际空间站上获得的鉴定结果与地面上的鉴定结果在物种层面上一致,这标志着首次完全在地球之外鉴定出微生物。

02. Asymmetric Isolation and the Evolution of Behaviors Influencing Dispersal:Rheotaxis of Guppies above Waterfalls

非对称隔离和影响分散行为的演变:孔雀鱼在瀑布上方的流变

Léa Blondel et al.

DOI:10.3390/genes11020180

封面故事:不对称隔离的种群,如瀑布上方的种群,有时可以向它们不接受移民的方向输出移民,这也为研究散布特征进化提供了极好的机会。本文研究了特立尼达岛Aripo河和Turure河瀑布上方的石斑鱼的流向 (后者是1957年从另一流域的瀑布下种群引入的),作者预测,由于对下游移民的强烈选择,这两个瀑布上方的种群应该表现出强烈的正流变性。与预期相符的是,两个种群都表现出高水平的正流变性,这可能反映了引进的Turure种群的当代 (快速) 进化。然而,这两个种群使用不同的行为来实现强正流变的相同性能,正如在对同一功能挑战的多种潜在进化解决方案 (即 "多对一映射") 的情况下所预测的。相比之下,研究结果没有发现在任何一条河流的小范围内,瀑布上方与下方的流变行为有任何差异,这表明在这种规模上的适应性分化受到限制。

03. History of DNA Helicases

DNA解旋酶的历史

Robert M. Brosh, Jr. and Steven W. Matson

DOI:10.3390/genes11030255

封面故事:DNA解旋酶是沿着磷酸二酯主链定向移动的运动酶,催化双链DNA的ATP依赖性解旋。从20世纪70年代中期首次发现依赖ATP的DNA解旋酶,到后来发现普遍存在于所有生命领域的依赖螺旋酶的途径的蓬勃发展,螺旋酶研究中的科学发现故事是丰富而翔实的。DNA解旋酶在核酸代谢的几乎所有方面都具有重要的作用,包括DNA复制和修复、重组、转录以及基因组稳定性的维持。许多实验室的研究已经阐明了它们的分子和细胞功能。DNA解旋酶的遗传缺陷是遗传性疾病和癌症的基础。在这一领域的持续工作有望对DNA解旋酶在基因组生物学中的重要影响产生新见解。

04. Radial or Bilateral? The Molecular Basis of Floral Symmetry

径向还是双边?花对称性的分子基础

Francesca Lucibelli, Maria Carmen Valoroso and Serena Aceto

DOI:10.3390/genes11040395

封面故事:花可以具有不同的对称形式:双边对称,如兰花蝴蝶兰;不对称如鹤望兰;或放射状的,如百日草。花的对称性的建立涉及许多转录因子。在植物进化过程中,MYB转录因子如DIVARICATA,RADIALIS和DRIF已获得了相互作用的能力,从而形成了DDR模块。该调节模块在确定建立何种花对称性方面具有关键作用。

05. Genetic Diversity and Population Structure of Llamas (Lama glama) from the Camelid Germplasm Bank—Quimsachata

骆驼种质库大羊驼 (Lama glama) 的遗传多样性和群体结构

Gabriela F. Paredes et al.

DOI:10.3390/genes11050541

封面故事:骆驼是秘鲁宝贵的遗传资源,它们的纤维可以用于制作服饰。目前骆驼的数量在不断减少中,在这种情况下,骆驼种质库—金萨塔 (Quimsachata) 收容了来自秘鲁不同地区的两种表型骆驼 (Chaku和Qara)。研究者对来自种质库的美洲驼种群的遗传变异性和分化进行评估后,发现个体之间存在高度的遗传变异,因此证明了适当的遗传管理措施可以保护和维持美洲驼的多样性。

06. Rapid Evaluation of CRISPR Guides and Donors for Engineering Mice

用于工程小鼠的CRISPR指导和捐助者的快速评估

Elena McBeath et al.

DOI:10.3390/genes11060628

封面故事:在尝试生成新的CRISPR小鼠模型的过程中犯错误可能会导致数千美元和数月时间的浪费。作者使用小鼠胚胎细胞一步一步地描述了一种在工程小鼠中使用CRISPR组分之前对其进行测试的快速、可靠和廉价的方法。作者发现与指南互补的DNA供体序列似乎比同义供体在发育中更早地被插入。同时,当供体在切割位点和所需突变之间每隔10 bp包含沉默突变时,增加两者之间的距离将不再减少成功的供体序列插入。

 
 
 
 
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