8月29日，记者从华大生命科学研究院获悉，该研究院牵头建设的基因组多维解析技术全国重点实验室联合多家机构，共同开发出时空组学技术Stereo-seq V2。该技术攻克了困扰医学界多年的福尔马林固定石蜡包埋样本分析难题，并实现在同一张组织切片上，同时对人体细胞（宿主）和入侵微生物的基因活动进行高分辨率“现场直播”。相关研究成果发表在《细胞》上。

Stereo-seq V2应用于不同保存年限的FFPE乳腺癌样本

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据了解，临床中超过90%的样本是福尔马林固定石蜡包埋样本，其便于保存且数量庞大。但在长期保存中，福尔马林固定石蜡包埋样本RNA完整性较差，一直以来被传统空间转录组技术“拒之门外”。

科研团队通过创新解交联技术和随机引物捕获策略，突破这一核心瓶颈，意味着全球医院病理科中积压的福尔马林固定石蜡包埋样本库，可被高效转化为前沿研究的“数据源”，为临床回顾性研究提供可能。

据悉，传统技术在分析“宿主-微生物”时，或只能单独看人体细胞，或需提前知道病原体种类才能设计探针检测，如同“盲人摸象”。

该创新技术通过无偏捕获样本中人类基因和微生物RNA，实现“宿主-微生物原位共分析”，推动生命科学研究从“看见细胞”迈向“看懂细胞与微生物战场”的精准医学新时代。

Stereo-seq V2检测结核杆菌感染小鼠肺脏的免疫动态变化

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值得一提的是，在抗体药物研发方面，Stereo-seq V2助力研发团队快速找到并定位抗原特异性中和抗体克隆，可大幅提高抗体药物的筛选效率，以推动肿瘤和感染性疾病的精准诊疗。

该成果的共同通讯作者、华大生命科学研究院博士李杨表示：“该技术作为‘生命数据引擎’，将驱动基础研究、临床诊断和新药研发进入一个更加精准、全面和原位的空间多组学时代。”

（科研团队供图）