近日,西安交通大学第一附属医院教授刘冰团队在《先进科学》封面发表了研究论文。该研究从细菌的天敌 “ 噬菌体 ” 入手,基于噬菌体天然的抑菌机制,创新性地开发出一类可精准靶向细菌类核相关蛋白HU的小分子候选药物——肉桂羟肟酸衍生物(CHADs),为解决全球抗生素耐药问题提供了全新策略。
全球范围内,抗生素耐药性正以前所未有的速度蔓延。传统抗生素靶点如细胞壁合成酶、拓扑异构酶等因长期使用已普遍面临耐药压力,开发作用于全新靶点、且不易诱发耐药突变的抗生素,成为当前抗感染领域亟待突破的关键难题。
针对这一困境,研究团队从噬菌体抑制HU的天然策略中获得关键启示。刘冰、王亚文团队发现,SPO1噬菌体分泌Gp46蛋白,通过特异性结合HU并阻断其与DNA的相互作用,导致细菌基因组失去结构稳定性,最终导致死亡,从而实现高效“结构性杀菌”。基于此机制,团队提出设想:能否开发出可模拟Gp46功能的小分子抑制剂,将HU转化为可成药的抗菌靶点?
为实现这一目标,研究团队运用华为科技的“盘古”药物大模型构建虚拟筛选体系,系统评估了DrugBank数据库中数千种化合物与HU–DNA界面的结合潜力。筛选结果显示,一类含有“肉桂羟肟酸”骨架的小分子可高度模拟Gp46的作用模式,稳定占据HU关键结合区域。研究团队据此将该类分子命名为:肉桂羟肟酸衍生物(cinnamic-hydroxamic-acid derivatives,CHADs),并展开系统性功能验证。
研究团队根据HU蛋白的特性与其参与的生物学功能,从核区解构、DNA拓扑紊乱到生物膜破坏,多角度地验证了CHADs对细菌生存的影响。CHADs处理后的细菌表现出典型的HU功能受损表型——核质弥散、细胞形态拉长、染色质结构紊乱。生化实验进一步证明CHADs可直接抑制HU与DNA的结合,从根本上破坏细菌基因组的三维结构组织。这种 “ 结构性杀菌 ” 方式不同于传统的代谢抑制或细胞壁靶向抗生素,它从细菌生命的最核心层面切断了生存基础。
该研究首次系统证实了HU作为抗菌药物靶点的“非拓扑酶依赖”,不仅为开发克服耐药菌感染的全新药物奠定了科学基础,也展示了一条从天然微生物互作中发掘抑菌策略、再通过AI手段实现小分子转化的创新研发路径。
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相关论文信息:https://doi.org/10.1002/advs.202509876
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