作者:张晴丹 来源:中国科学报 发布时间:2023/7/14 0:09:58
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全程氨氧化菌环境分布与偏好研究获进展

 

中国热带农业科学院环境与植物保护研究所(以下简称环植所)农业环境研究团队在陆地生态系统中全程氨氧化菌环境分布与偏好的机器学习预测研究方面取得新进展。

针对前人研究只考虑非生物性预测因子(如土壤、气候)来预测土壤全程氨氧化菌环境分布与偏好,忽略共存物种(如半程硝化微生物AOA、AOB)作为预测因子的重要性问题,团队提出新的机器学习预测模型框架,即考虑共存物种作为预测因子,证实了全程氨氧化菌丰度的生物性预测因子的预测能力强于非生物性预测因子。该成果为利用机器学习算法研究陆地生态系统中全程氨氧化微生物环境分布规律与适应机制提供了新思路。近日,相关研究成果发表在Soil Biology and Biochemistry上。

研究结果表明:作为全程氨氧化菌丰度的潜在生物预测因子,AOA、AOB预测能力强于非生物性预测因子如土壤pH、铵含量;作为分支(Comammox Nitrospira clades A and B)丰度的有效预测因子,土壤pH、铵含量并不能有效预测总体丰度;不考虑共存物种影响的机器学习预测,即只考虑非生物性因子作为预测因子,有可能产生预测偏差,而抬升非生物性预测因子的权重与排序,致使不能正确识别变量重要性与重要性变量;而重要性变量识别不准,就难以通过预测重要性变量的边际效应来预测环境偏好。

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全程氨氧化菌环境分布与偏好的机器学习预测    中国热科院供图

该研究得到了海南儋州热带农业生态系统国家野外科学观测研究站支持,得到了广东省面上基金、国家自然科学基金、海南省重点研发计划、海南省自然科学基金等项目的资助。

相关论文信息:https://doi.org/10.1016/j.soilbio.2023.109079

 
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