作者:刁雯蕙 来源:中国科学报 发布时间:2022/4/14 19:07:12
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全球GPCR-DOCK 2021大赛结果公布
深圳先进院团队获全球前三

 

4月13-14日,第七届国际iHuman GPCR论坛线上召开,会上公布了全球GPCR-DOCK 2021大赛结果,中国科学院深圳先进技术研究院医药所袁曙光学术团队在全球45个团队提交的近800个参赛预测模型中脱颖而出,斩获前三。
 
G蛋白偶联受体蛋白(GPCR)是最重要的药物靶点,人体内总共有820多种不同的GPCR,与几乎所有的人类重大疾病均密切相关。近40%的上市药物都针对GPCR而开发。
 
据了解,国际GPCR-DOCK大赛由著名结构生物学家Raymond C. Stevens等发起,已成功举办四次,旨在验证当今生物计算和AI方法能否正确预测出GPCR的三维结构折叠以及相关药物分子与GPCR的结合模式,为当今GPCR药物研发提供理论指导。
 
袁曙光团队针对5个重要的药物靶点G蛋白偶联受体蛋白(GPCR)的三维结构折叠及其药物分子结合模式进行了精准预测,靶标整体结构原子位置平均RMSD(root-mean-square deviation)与实验结构相比只有1.96埃(Å)的差别;而关键性的七次跨膜区域的原子位置平均RMSD与实验值相比只有1.29 埃的差别。
 
据大赛组织者之一美国UCSD的Irina Kufareva教授介绍,本次大赛的5个靶点预测难易程度分别为:GPR139<NPY1R<APJ<NMUR2<kOR。袁曙光团队在kOR等靶点预测中斩获全球前三甲,相关预测不仅正确复现出GPCR折叠模型,并获得精准的药物分子结合模型。

 

 
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