作者:张行勇 严涛 来源:中国科学报 发布时间:2022/10/9 19:17:48
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西安光机所研发出颜色迁移傅里叶叠层显微术方法

 

论文首页。

CFFPM方法的恢复流程及结果对比。 论文作者供图

使用光学显微镜进行病理切片检查是癌症诊断的“金标准”。然而传统的数字病理学常常使用高倍物镜和扫描拼接的方法来获得大视场、高分辨率图像,高精密电动位移台、高倍物镜、脉冲光源等组件价格昂贵,提高了仪器设备的成本,大量的机械运动也会减缓成像的时间效率。同时,高倍物镜带来的景深狭小和机械扫描拼接带来的伪影、重影、失败问题等也降低了成像的质量。

2013年发明的傅里叶叠层显微术(Fourier ptychographic microscopy, FPM)使用低倍物镜获得天然的大视场,可通过多角度扫描方式采集一组低分辨率图像,在频域中迭代重构获得高分辨率的结果。这一成果无需机械扫描就能获得高分辨率、大视场图像,而有效地解决了传统扫描成像的质量问题,突破了传统显微成像中分辨率与视场之间的矛盾关系,使得在数字病理学中实现高通量成像成为可能。

全彩色FPM成像对于分析标记的组织切片至关重要。传统扫描拼接依托彩色相机速度很快,尽管FPM技术在单通道下有高通量优势,但是彩色化下使用传统的RGB序列照明合成则会缩小3倍通量,因此如何在保持精度的同时提高彩色化效率,保持高通量的优势,突破精度与效率的矛盾关系成为了主要的科学问题。

2021年,中国科学院西安光学精密机械研究所潘安、马彩文、姚保利团队提出了一种称为颜色迁移傅里叶叠层显微术(CFPM)的方法,在几乎无精度损失的情况下将效率提高了3倍,相关工作以封面文章形式发表于《中国物理、力学与天文学》 (Science China Physics, Mechanics & Astronomy )。但是,由于缺乏对颜色传递过程中空域信息约束,该方法无法恢复多色染料染色的复杂样品,且极大依赖GPU的并行计算。

为此,该团队又进一步提出了一种改进的FPM全彩色成像算法,称为颜色迁移滤波傅里叶叠层显微术(CFFPM)。该方法将交叠分块、三边滤波与全彩色FPM迁移学习模型相结合,前者降低了解空间的搜寻范围,后者引入了空域的先验信息,有效地匹配了最合适的颜色传递像素和滤除了杂色,也进一步通过迭代在两个色彩空间的颜色精炼,从而彻底克服了CFPM的重要缺陷。

据了解,他们通过实验对比了26个样本的统计结果,精度方面,CFPM和CFFPM与RGB序列照明方法相比均方误差分别高4.76%和1.26%;视觉效果方面,CFFPM能够有效分辨多色染料染色的复杂样本,结果与RGB序列照明方法难以分出差别;时间效率方面,与RGB序列照明方法相比,CFPM和CFFPM都具有更高的效率,与在CPU上运行的CFPM相比,CFFPM方法的运行时间从几小时减少到几分钟;临床应用方面,因颜色精度对于病理判断至关重要,同时,简单地加快成像速度会导致彩色成像的精度损失。而CFFPM在两者之间做到了较好的取舍,在快速成像的同时保持了高精度彩色成像的优势,使得结果能够被病理学家可用可接受,特别是对时间敏感的术中病理,具有重要的应用前景。此外,CFFPM无需GPU加速,由于其低成本硬件要求,可广泛推广到实际应用中,为计算光学成像在数字病理学中的临床应用提供了新思路。

其相关成果于2022年9月30日在线发表于 《光子学研究》(Photonics Research) 。

该领域的相关专家认为,此项工作将先验的空域信息和颜色空间迭代精炼思想引入到了快速全彩色FPM研究中,对于促进FPM在数字病理学中的发展具有重要意义。

据悉,潘安、马彩文、姚保利团队在计算光学显微成像方面开展了长期系列创新型研究工作,积累了大量研究成果。该项目前期所开展的基础性研究得到了国家自然科学基金重大科研仪器研制项目、面上项目、青年项目等项目的支持,为该论文实现关键技术攻关及预期研究目标奠定了良好的基础。

论文相关信息:https://doi.org/10.1364/PRJ.473038

 
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