作者:雷禹 童宽 黄辛 来源:中国科学报 发布时间:2021/11/24 9:12:32
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全球最新IO500榜单公布
瑞金医院大科学设施ASTRA平台获全球第八

 

 
 
大数据平台平台高密度冷板式水冷计算刀箱。上海交大医学院供图
 
近日,国际超级计算大会SC21正式公布全球最新IO500榜单。上海交通大学医学院附属瑞金医院转化医学大科学设施建设的大数据平台ASTRA跻身前十,位列第八。
 
据悉,目前AI和大数据正在各行各业渗透,算力和存储性能是评价超算平台的重要指标。转化医学大科学设施研究员吕纲表示,ASTRA平台从存储性能上打破了生信行业的天花板,随着高性能计算技术与医学研究的融合,高效的存储技术会推动未来生信分析和AI技术在临床的应用。
 
ASTRA平台隶属于转化医学国家重大科技基础设施(上海)生信大数据平台。转化医学国家重大科技基础设施(上海)是“十二五”期间国家重点规划的16项重大科技基础设施之一,是中国在生物医药领域的国家级大设施。上海交通大学和上海交通大学医学院附属瑞金医院为大设施两大建设主体。
 
IO500是高性能计算领域针对存储性能评测的全球排行榜,是高性能计算领域最权威的榜单之一。转化医学大科学设施是首次参评的医疗机构,该平台由瑞金医院和intel工程师一起经过近半年的准备和技术反复优化,最终提交评测。
 
生物标记物和新药研发平台是转化医学国家重大科技基础设施技术支撑系统的重要组成之一,目标是建立致力于提供系统鉴定用于疾病早期诊断、预防、分子分型和指导个体化治疗的生物标记物的平台,并围绕临床实践建立系统筛选与验证干预疾病的药物靶点及研发新型靶向治疗方法的平台,为新型疾病诊疗研发开辟一条快捷的新途径。
 
据介绍,在转化医学的背景下,生信大数据平台采取了定制化的高性能计算平台技术思路,为生信计算的“存”“传”“算”“用”四个方面,即数据存储、数据传输、数据分析计算和数据的整合应用,量身定制相关技术。
 
 
 
 
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