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Butler-高效基因组分析工具
作者:小柯机器人 发布时间:2020/2/13 10:08:36

德国欧洲分子生物学实验室Jan O. Korbel和Sergei Yaknee合作开发了可对数千种人类基因组进行基于云的快速分析工具-Butler。相关论文2020年2月5日在线发表在国际学术期刊《自然—生物技术》上。

研究人员研发了一种计算工具Butler,其促进了对公共云和学术云的大规模基因组分析。 Butler包括创新的异常检测和自我修复功能,与当前算法相比,该方法将数据处理和分析的效率提高了43%。通过Butler,可以高效、统一地处理泛癌症全基因组分析(PCAWG)项目中725 TB的癌症基因组数据集。

附:英文原文

Title: Butler enables rapid cloud-based analysis of thousands of human genomes

Author: Sergei Yakneen, Sebastian M. Waszak, Michael Gertz, Jan O. Korbel

Issue&Volume: 2020-02-05

Abstract: We present Butler, a computational tool that facilitates large-scale genomic analyses on public and academic clouds. Butler includes innovative anomaly detection and self-healing functions that improve the efficiency of data processing and analysis by 43% compared with current approaches. Butler enabled processing of a 725-terabyte cancer genome dataset from the Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes (PCAWG) project in a time-efficient and uniform manner.

DOI: 10.1038/s41587-019-0360-3

Source: https://www.nature.com/articles/s41587-019-0360-3

期刊信息

Nature Biotechnology:《自然—生物技术》,创刊于1996年。隶属于施普林格·自然出版集团,最新IF:31.864
官方网址:https://www.nature.com/nbt/
投稿链接:https://mts-nbt.nature.com/cgi-bin/main.plex