来源:ExRNA 发布时间:2019/2/22 14:12:16
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期刊:ExRNA

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2019年2月14日,BMC期刊又迎来新的一员:ExRNA 。该刊由南京大学主办,BMC 合作出版,旨在发表细胞外RNA(extracellular RNA,简称ExRNA)领域的创新研究,涵盖细胞外环境中的多种RNA,包括miRNA、siRNA、piRNA、tsRNA、snRNA、snoRNA、lncRNA、circRNA等,内容覆盖所有与细胞外RNA相关的主题,包括但不限于:细胞外RNA的体内分布、结构和生物学功能;细胞外RNA的产生、转运、摄取、加工和修饰的分子机制;细胞外RNA作为新型疾病标志物及治疗靶点的研究及其它临床新应用;检测和分析细胞外RNA的新技术、新策略。

ExRNA 由南京大学生命科学院张辰宇院长担任主编,与来自全球的多位行内知名专家一同组成专业编委会,共同关注细胞外RNA研究领域中的新发现。主编及其团队将致力于将ExRNA 打造成相关学术研究领域的国际化交流平台。

作为开放获取期刊,ExRNA 目前所有稿件出版费将由南京大学承担,作者无需支付任何费用。

ExRNA 新作点评

Extracellular RNA in renal diseases

Yang Zhou, Junwei Yang

DOI: 10.1186/s41544-018-0001-x

本综述总结了细胞外RNA在肾脏病领域的研究进展。作者在介绍细胞外RNA的种类和特征的基础上,列举了在急性肾损伤、慢性肾脏病、多囊肾病、糖尿病肾病、狼疮性肾炎、肾脏肿瘤和肾移植等疾病的发生进展过程中细胞外RNA的变化特征及其对疾病诊断和治疗意义,指出细胞外RNA的分离和检测方法仍然是制约其应用的主要因素,并提出在临床病例中探究细胞外RNA的病理生理学作用机制及进一步研究其作为肾脏疾病诊断、预后判断和疗效评估的生物标志物的临床价值是未来的研究方向。

编者按:本文作者结合自身多年的临床和研究经验,对不同类型肾脏疾病中细胞外RNA的变化特征进行了总结,指出了这些细胞外RNA的病理生理学意义,对该研究领域的未来发展具有重要启示作用。

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Biogenesis and biological implications of isomiRs in mammals- a review

Jasdeep Kaur Dhanoa, Ramneek Verma, R. S. Sethi, Jaspreet Singh Arora, C. S. Mukhopadhyay

DOI:10.1186/s41544-018-0003-8

isomiR是miRNA的变体,是由于核苷酸添加、缺失或取代而在传统miRNA序列的3和/或5末端产生变异而生成的异构体,其产生的具体机制未有定论,猜测其可能是由于drosha或dicer酶对miRNA序列的不精确切割或在miRNA生成过程中在3末端添加核苷酸而产生的。本综述总结了isomiR在基因调控、进化、RNA干扰和肿瘤细胞分化等各个方面的生物学作用,归纳了isomiR的多维角色及其在不同物种中的生物学意义,并对常用研究手段进行了概述。作者进一步指出,由于isomiR与各种疾病途径有关,因此有望用作人类疾病的生物标志物,其在癌症和其他疾病中扮演的角色也有待进一步研究。

编者按:近年来涌现出越来越多的有关isomiR的研究,形成了新的miRNA研究方向,扩展了miRNA研究范畴。本文对这一研究方向进行了梳理,归纳了isomiR研究方向取得的最新进展,并展望了未来的研究方向,为本领域研究者提供了很好的借鉴和参考。

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microRNAs in viral acute respiratory infections: immune regulation, biomarkers, therapy, and vaccines

Stephen A. Leon-Icaza, Mingtao Zeng, Adrian G. Rosas-Taraco

DOI:10.1186/s41544-018-0004-7

miRNA在发生病毒性急性呼吸道感染时变化显著,这种变化可能是导致此类疾病高发病率和死亡率的原因之一。近年来,科学家研究了病毒性急性呼吸道感染疾病相关miRNA的作用,为发现新的抗病毒药物靶点以及鉴定新的疾病诊断、监控和预后标志物提供了思路。本综述对miRNA在病毒性急性呼吸道感染疾病中的调控作用进行了归纳整理,涵盖了其在先天免疫反应中的作用、作为生物标志物的可行性以及用于治疗和疫苗开发的潜力等方面的内容。

编者按:本综述较为全面地描绘了miRNA在病毒性急性呼吸道感染过程中所扮演的角色,涵盖了从致病机理到诊断治疗等各个方面的内容,对后续研究有重要启示作用。

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Circulating miR-122 levels in self-recovering hepatitis E patients

Bangari Haldipur, Vidya Arankalle

DOI:10.1186/s41544-019-0006-0

戊型肝炎在发展中国家普遍存在,其感染后能够自愈,但易导致妊娠期胎儿死亡。miR-122是肝脏中含量最丰富、最特异的一种miRNA,与乙肝、丙肝等病毒性肝炎相关。本研究旨在鉴定戊肝感染时血清中miR-122的变化情况,研究者利用qRT-PCR检测了戊肝感染患者及健康对照血清中miR-122的水平,发现未怀孕的戊肝患者血清中miR-122显著下降,怀孕的急性期戊肝感染患者血清中miR-122升高,并在恢复期中不断降低,而且发现血清miR-122水平与传统血清生物标志物存在一定相关性。本研究首次报道了戊肝感染患者血清中miR-122的变化情况,证明了血清miR-122水平与戊肝病程相关,显示了miR-122作为妊娠期戊肝感染的预后标志物的潜在临床价值。

编者按:由于戊型肝炎能够自愈的特点,其危害性(导致胎儿死亡)未能得到普遍重视,因此相关研究较少。本研究发现通过检测血清中的miR-122水平能够反映怀孕病人戊肝的感染进程,为临床上戊肝感染的疾病监控和预后判断提供了一种潜在的非侵入性的生物指标。

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Mobile RNAs—the magical elf traveling between plant and the associated organisms

Shuo Zhang, Zhi Hong

DOI:10.1186/s41544-019-0007-z

small RNA在植物的生长发育中发挥着重要作用。研究表明small RNA不仅在单个细胞中发挥作用,并且可以进行远距离传输,甚至跨物种发挥调控作用。本综述总结了mobile RNA尤其是mobile small RNA在植物及其相关生物之间交流的新进展,包括mobile small RNA在真菌感染与宿主博弈、寄生植物与宿主防御、植物miRNA与动物基因调控等方面的作用,较为系统地阐述了small RNA作为移动信号在物种中进行跨界调控的现象,表明small RNA在物种之间可能充当了一种通用的“信息交流语言”的作用,并指出了这一作用在农业生产和疾病治疗等方面的应用前景。

编者按:本文着眼于自然界中客观存在的small RNA在植物与其他生物之间跨物种传递的现象,在描述现象的同时介绍了small RNA跨界调控基因表达的作用及其生物学意义,进而提出了这一研究领域中亟待解决的新问题,对厘清后续研究的方向以及阐明其应用价值具有重要意义。

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Current experimental strategies for intracellular target identification of microRNA

Jinbo Li and Yan Zhang

DOI:10.1186/s41544-018-0002-9

本文综述了目前miRNA细胞内靶点识别的实验方法,主要包括基因表达谱分析、免疫沉淀法和pull-down法这三类:基因表达谱分析主要基于过表达或抑制特定miRNA后,检测目的基因表达;免疫沉淀法通过利用特定抗体分离RISC复合物和目标mRNA,再进行高通量技术测定;pull-down法则利用标记了的miRNA作为探针分离与之结合的mRNA。每种策略都有其固有的优势和局限性。总之,本文简要概述了近年来在miRNA靶点识别实验策略方面取得的成果。这些实验策略的进一步完善将对miRNA的基础和应用研究起到很大的作用。

编者按:了解miRNA参与的细胞过程,尤其是清楚识别细胞内miRNA的调控靶点,对于miRNA研究至关重要,也仍然是miRNA相关研究中的一个重大挑战。这篇综述对目前常见的miRNA靶点识别方法进行了总结,并介绍了识别miRNA靶点的新技术。

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miRNAs in cancer therapy: focusing on their bi-directional roles

Wei He, Jinzhi Xu, Zhen Huang, Junfeng Zhang and Lei Dong

DOI:10.1186/s41544-019-0005-1

在本文中,贺威等报道了miRNA失调是导致大多数癌症的原因之一,与癌症的发生、发展存在着密切的关系,已经成为肿瘤治疗的一个很有吸引力的靶点。miRNA作为肿瘤治疗新靶点的证据绝大部分是依靠miRNA对癌细胞本身的影响及利用免疫缺陷小鼠模型获得的,但是癌组织中不单单有癌细胞本身,其还包括基质细胞,如发挥抗肿瘤作用的T细胞。同时,肿瘤的发生和发展与T细胞活化、增殖及功能共用某些信号通路,这就导致某些miRNA既能促进(抑制)癌细胞生长,也能增强(抑制)T细胞的抗肿瘤活性。miR-21、miR-155、miR-17~92既促进癌细胞生长,也能增强T细胞的抗肿瘤活性;相反,miR-139和miR-342既抑制癌细胞生长,也能抑制T细胞的抗肿瘤活性。因此,基于miRNA的肿瘤治疗也可以杀死T细胞和其他淋巴细胞,最终导致促进癌症生长。本文重点综述了具有双向调控作用的miRNA及它们对肿瘤治疗的潜在影响,将促进大家对miRNA用于癌症治疗的进一步讨论,也为设计更有效和更安全的癌症治疗策略提供新视角。

编者按:在本文中,重点讨论了在癌症治疗中, miRNA可能具有的双向作用,以及它们的潜在影响。作者强调了筛选鉴定出能够促进T细胞产生抗肿瘤免疫反应,并抑制肿瘤细胞生长的miRNA,对设计出更安全有效的基于miRNA的癌症治疗策略至关重要。

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Extracellular microRNAs initiate immunostimulation via activating toll-like receptor signaling pathways

Hongwei Liang, Koby Kidder and Yuan Liu

DOI:10.1186/s41544-019-0009-x

自从10年前发现血浆和其他体液中稳定存在着细胞外miRNA以来,越来越多的研究报道了细胞外miRNA作为基因表达的新型调控作用。其中绝大多数研究表明,细胞外miRNA通过在外泌体介导的miRNA分泌吸收途径,到达受体细胞后以传统的miRNA调控方式调控靶基因的表达。但最新研究表明,细胞外miRNA和类似miRNA的小RNA也可以通过直接结合Toll-like受体(TLR)激活下游通路,快速调节先天免疫和神经功能,通过非传统的方式发挥调控作用。

编者按:在这篇综述中,作者重点介绍了细胞外miRNA或类似miRNA的小RNA能够直接激活TLR信号通路来调节免疫反应的现象,并对这种不同于传统miRNA作用方式的新型细胞外miRNA作用方式的最新见解进行了总结,为细胞外miRNA研究提供了新的思路。

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张辰宇教授

ExRNA 主编

南京大学生命科学学院院长、教授;杰青、长江学者。

张辰宇长期从事非编码RNA、线粒体功能与细胞代谢及代谢性疾病的基础生物医学及其临床转化方面的研究。在Cell、Molecular Cell、Cell Metabolism、Cell Research等期刊发表论文224篇;累计影响因子(5年IF)1637.58分,其中IF > 10有48篇;他引17387次;H指数52;13篇论文入选ESI全球前1%高被引用论文;共有28项国际和33项国内发明专利被授权,部分已经转化应用。曾获教育部自然科学一等奖、教育部技术发明一等奖、谈家桢生命科学创新奖;主持两项“973”项目。

阅读英文全文请访问:

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期刊介绍:

ExRNAhttps://exrna.biomedcentral.com/) is a peer-reviewed, open access journal that provides a platform for innovative research in the field of extracellular RNA. The journal covers a wide variety of RNAs in the extracellular environment, including miRNAs, siRNAs, piRNAs, lncRNAs and circRNAs.

(来源:科学网)

 
 
 
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