作者:姚礼山等 来源:《应用化学》 发布时间:2017/5/9 13:59:55
选择字号:
研究揭示蛋白质盐桥形成机制

 

在蛋白质中,盐桥影响蛋白质的功能及理化性质,如酶的催化、蛋白质-蛋白质相互作用、蛋白质-DNA/RNA相互作用、分子识别等,但是盐桥形成机制目前还不清楚。中国科学院青岛生物能源与过程研究所仿真模拟团队利用该团队优化的pH滴定方法,测量了GB3中4对盐桥在不同温度条件下的强度(见图1),并阐明了盐桥形成的机制。
 
研究发现,蛋白质盐桥会随着温度的升高而增强,通过范德霍夫方程(-2.303DpKa = DH/RT -DS/R)拟合得到DH 和DS,DH > 0和DS > 0,表明熵驱动了盐桥的形成,而焓变不利于盐桥的形成(表1)。随后,研究人员采用分子动力学模拟方法计算了盐桥自由能随温度的变化,结果和实验结论一致。计算研究表明,去溶剂化熵对盐桥的形成起到了主导作用(见图2),即盐桥的形成导致了原本围绕在离子周围的水分子被释放,从而增加了溶剂的熵值。研究成果发表于《德国应用化学》。
 
以上研究由青岛能源所仿真模拟团队研究员姚礼山主持完成,获得国家自然科学基金的支持。(来源:中科院青岛生物能源与过程研究所)
 
    文章链接
 
 
图1  优化的pH滴定方法 
 
 
表1 盐桥的热动力学参数  
 
 
图2 分子动力学模拟盐桥(H31-E27)形成所需的自由能
 

 

 
 
 
特别声明:本文转载仅仅是出于传播信息的需要,并不意味着代表本网站观点或证实其内容的真实性;如其他媒体、网站或个人从本网站转载使用,须保留本网站注明的“来源”,并自负版权等法律责任;作者如果不希望被转载或者联系转载稿费等事宜,请与我们接洽。
 
 打印  发E-mail给: 
    
 
以下评论只代表网友个人观点,不代表科学网观点。
SSI ļʱ
 
相关新闻 相关论文

图片新闻
缓解肠易激综合征  饮食比服药更有效 银河系发现巨大黑洞
史上最亮伽马射线暴来自一颗坍缩的恒星 导师:年年审毕业论文,总有这些问题!
>>更多
 
一周新闻排行 一周新闻评论排行
 
编辑部推荐博文
 
论坛推荐