作者:Christof Winter 来源:《PLoS计算生物学》 发布时间:2012-5-29 10:49:59
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搜索算法有助发现肿瘤标志物
 
搜索引擎不但能够用来查找网页,还能被用来确定肿瘤标志物。据物理学家组织网近日报道,德国德累斯顿工业大学的研究人员日前使用改良过的搜索引擎算法发现了7个肿瘤标志物,这些标志物不但可以帮助医生对患者的病情作出准确诊断,还能帮助研究人员据此开发出新的抗癌药物,在临床上具有重要价值。相关论文发表在最新一期的美国《公共科学图书馆—计算生物学》上。
 
此前要找到这些标志物需要经过大量的实验,不但费时而且费力。另外一个问题是,在不同的研究中所发现的标志物总是各不相同,无法相互印证。德累斯顿工业大学的科学家发现这与搜索引擎在处理大量重复网页和超链接时所遇到问题颇有几分类似。于是他们对谷歌网页排名(PageRank)算法进行了改造,按与胰腺癌的相关性对2万个蛋白质进行了排序,结果从中发现了7个肿瘤标志物。这些生物标志物可以帮助医生对癌症早期的体液或由手术中所获得的活体组织进行检查,以确定患者是否需要接受化疗。
 
研究人员发现,一旦将网络信息加入到分析当中,这些标志物就会变得更易重复。其中一项就与美国北卡罗来纳大学早期的一项重要发现相重叠,该标志物能对胰腺癌的侵略性进行评估。
 
论文第一作者克里斯托夫·文特说,虽然新的生物标志物看起来比目前所使用的更多更全面,但它们还需要经过进一步的研究和临床试验才能获得应用。“但不管怎么说,我们成功迈出了第一步。”文特说。目前该研究小组已经与几家生物技术公司展开了合作,胰腺癌药物的临床试验也已逐步展开。(来源:科技日报 王小龙)
 
 
 
 
 
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