作者:贾娜 孙洁 来源:科技日报 发布时间:2021/9/28 10:46:28
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国际社会应在多国多地开展新冠病毒溯源

 

溯源是科学问题,应当尊重科学,尊重事实。《中国和世卫组织新冠病毒溯源联合研究报告》明确指出,溯源工作应基于全球视野,未来溯源工作不会局限于某一区域,需要多国多地开展。

一、中国武汉华南海鲜批发市场并非疫情起源地

在新冠疫情早期,就有多篇报道证明,华南海鲜批发市场并非疫情起源地。比如,2020年1月24日《柳叶刀》杂志一项回顾性调查研究表明,2019年12月16日至2020年1月2日期间武汉市首批实验室确诊的41名新冠肺炎病例中,最早出现症状的病例可以追溯到2019年12月1日,且该患者无华南海鲜市场暴露史。另外13例也无华南海鲜市场暴露史。2020年1月26日,《科学》杂志发表一篇通讯报道,认为新冠病毒可能并非源于华南海鲜市场。该判断是根据上述《柳叶刀》杂志1月24日刊载的论文。在这篇报道中,美国乔治城大学传染病专家Daniel Lucey接受采访时说,考虑到病毒潜伏期和无症状感染等因素,首个新冠病毒感染者可能在2019年11月或更早时候就已经出现了(不一定是在武汉)。2020年1月29日,中国疾病预防控制中心发表在《新英格兰医学杂志》的另一项回顾性研究,调查了从2019年12月至2020年1月22日报告的425名实验室确诊的新冠肺炎早期病例。研究结果显示,2020年1月1日之前发病的患者中仅55%与华南海鲜批发市场有关,且2019年12月8日出现的第1例确诊病例并无华南海鲜市场暴露史。12月13日才出现第一个与华南海鲜批发市场相关病例,12月19日—23日集中出现与华南海鲜批发市场相关病例,且确诊病例大部分与华南海鲜批发市场相关,12月29日开始出现明显与华南海鲜批发市场无关的病例。由此可见,早期病例中就存在与华南海鲜批发市场无关的病例。

另一方面,从病毒基因组的进化分析表明,新冠病毒的出现时间最有可能为2019年10月至12月之间;此外,对新冠病毒早期序列的分析还表明其主要存在两类序列。而如果以蝙蝠冠状病毒RaTG13作为进化上的外群参照进行分析,可以发现武汉华南海鲜市场的新冠病毒属于以上两类序列中出现时间较晚的类型。因此,华南海鲜市场中的新冠病毒更可能来自于其他地方。

最后,需要指出的是,疫情的初始暴发地可能不是其起源地。例如,在对HIV的溯源过程中发现,虽然HIV首次于1983年在美国暴发,但后来发现其在1959年采集的血样中就已经存在。进一步研究表明,源自非洲的SIV病毒(猴免疫缺陷病毒)可以通过多次传播后具备感染人的能力,从而确认了HIV起源于非洲。

二、尚未找到病毒的动物宿主,需要多国多地开展动物溯源研究

目前,全球范围内已有不少对蝙蝠携带新冠相关冠状病毒的研究,在中国、柬埔寨、日本、泰国、英国、保加利亚、肯尼亚等地都发现了新冠相关冠状病毒的报道。这些新冠相关冠状病毒均发现于菊头蝠属的蝙蝠,表明这类蝙蝠可能是新冠病毒的自然宿主。其中,与新冠病毒相似度最高的是蝙蝠冠状病毒RaTG13,但是,序列方面,RaTG13与新冠病毒仍相差1100多个碱基,在结合受体的特征以及宿主范围方面,RaTG13也与新冠病毒具有显著差距,因此,不能说RaTG13是新冠病毒的源头,而是RaTG13和新冠病毒可能有共同的祖先。另外,根据最新统计,全球共有98种菊头蝠,广泛分布于整个欧亚大陆的南部,包括东南亚、中国南部、东亚、南亚、南欧,以及撒哈拉以南非洲。

穿山甲有很大的可能是一个中间宿主,原因是在穿山甲中发现过两种与新冠病毒相似度分别达到85.5%和90.4%的类新冠病毒GX/P2V/2017以及GD/1/2019。全球共有8种穿山甲,主要分布范围在东南亚、中国南部、南亚,以及撒哈拉以南非洲。另外,水貂也可能是中间宿主,它是唯一已知的暴发新冠疫情的动物,而且水貂中传播的新冠病毒又发生了感染人事件,提示新冠病毒在水貂中的感染和传播具有良好的适应性,因此水貂可能在新冠病毒的演化中发挥了作用。野生欧洲水貂在整个欧洲都有分布。但美洲水貂用于皮毛养殖,主要引自美国,在欧洲多国和中国北方存在水貂养殖厂。

综上所述,目前还没有确定新冠病毒真正的动物宿主,而几种潜在动物宿主都是全球分布,新冠病毒从源头到中间宿主的传播可能发生在多个地点,包括东南亚、中国南部、南亚、欧洲,以及撒哈拉以南非洲。此外,由于新冠相关冠状病毒在以上多个地区的蝙蝠群体中传播,这些病毒有可能在多地独立进化。

三、多国多地首发病例报告时间一再提前,需要全球溯源寻找病毒真正起源地

1.美国早期病例报告时间一再提前。

(1)大流行前流感样病例中恐有新冠病人

从2019年10月1日到2020年4月15日期间,美国疾控中心FluSurv-NET(流感住院监测网络)站点共报告了19845例实验室确认的流感相关住院病例,其中56例(0.3%)未确定病毒类型。2020年3月,美国南加州大学医学中心Brad Spellberg等人发表在《美国医学会杂志》的研究,分析了3月中旬当地疫情早期洛杉矶一家医院中的131名流感样病例患者,结果显示有5.3%(7例)患者的新型冠状病毒核酸检测呈阳性,推测此前一些流感样病例实际上可能是新冠病毒携带者。且全部7例患者仅有一名有美国国内旅行史,提示当地在疫情早期即可能存在社区传播现象。

(2)美最早病例恐比本土首例报道病例早1个月

2020年11月30日,美国疾控中心研究人员发表在《临床传染病》杂志上的一项研究显示,根据对美国红十字会储存的2019年12月13日—2020年1月17日期间美国9个州的7389例常规献血存档样品进行了回顾性筛查,发现早在2019年12月13日至16日期间,美国加利福尼亚、俄勒冈州和华盛顿州三个州至少39人的血液中已经出现新冠病毒抗体。这比美国官方报告的第一例美国本土确诊病例还要早一个月,比中国正式确认新冠病毒早数周。

(3)多个州出现新冠感染的时间比最初报告病例的时间要早

2021年6月15日,由美国国立卫生研究院(NIH)等团队联合完成的一项最新研究,发表于国际权威期刊《临床传染病》。在“我们所有人(All of Us)”的研究计划中,研究人员分析了超过2.4万份储存的血液样本,这些样本是2020年1月2日至3月18日期间来自美国50个州的项目参与者提供的。研究人员使用两种不同的血清学测试,最终在9名参与者的样本中检测到了抗SARS-CoV-2的抗体。这表明,美国至少有5个州出现SARS-CoV-2感染的时间比之前最初报告病例的时间要早,这些州在2019年12月已有人感染新冠病毒。

2.法国早期病例报告时间一再提前。

(1)法国首例病人并不是中国相关输入病例

2020年4月29日,法国巴斯德研究所Fabiana Gambaro等人发表在预印本平台《生物预印本》(bioRxiv)的一项研究分析了1月24日至3月24日间收集的97份法国病毒样本基因序列,结果显示,法国现今流行的病毒样本中,最早一个样本采集于2月19日,该患者没有国内外旅行史,也没有和海外归国的旅行者接触过,该患者2月25日去世,随后法国出现大规模疫情潮。该研究已在2020年7月2日正式发表在《Eurosurveillance》上。

(2)法最早病例恐比本土首例报道病例早1个月

2020年5月,法国巴黎第十三大学A Deslandes等人发表在《国际抗菌剂杂志》的一项研究回顾性检测了2019年12月2日至2020年1月16日在法国两家医疗机构接收ICU治疗的14名患者样本,从而发现了一名新型冠状病毒肺炎感染病例。该患者最近一次旅行是2019年8月前往阿尔及利亚,发病前没有中国及周边地区旅行史。该患者的一名子女在他出现上述症状前也曾出现过流感样症状。该结果提示,新冠病毒在法国的出现时间,比先前发现本土首发病例的1月24日提早了一个月。

根据法国媒体Franceinfo于2020年5月3日的报道,2019年12月27日,法国巴黎一家郊区医院收治的一例疑似肺炎患者的新型冠状病毒核酸检测呈阳性。艾维森纳(Avicenne)医院和让韦迪耶(Jean-Verdier)医院急诊科负责人Yves Cohen表示,近期医院对2019年12月底采集的一份咽拭子样本进行新型冠状病毒核酸检测,结果呈阳性。该患者43岁,无国外旅行史,应该是在2019年12月14日至22日之间感染了新型冠状病毒。

2020年5月7日,法国上莱菌省科尔马市的阿尔贝·施韦泽医院发表公告称,该医院2019年12月2日收治的一名男性患者确诊为新冠肺炎。该医院影像部负责人重新研究了2019年11月1日至2020年4月30日,总计2456张胸片底片,其中2019年11月至12月之间共有15例带有典型新型冠状病毒肺炎症状的疑似病例,最早的疑似病例可追溯到2019年11月16日。该院医学影像部负责人Miche Schmitt医生对法国新闻网franceinfo表示说,对该15个疑似病例进行新型冠状病毒检测,证实其中一名于12月2日入院的疑似病例为新型冠状病毒感染者。该男性患者57岁,尚不清楚感染来源。

3.意大利早期病例报告时间一再提前。

(1)意最早病例恐比首例报道病例早1个月

意大利巴伦第大区是该国首先出现新型冠状病毒肺炎疫情的地区之一, 2020年2月20日在伦巴第大区报告了意大利本土的1号病例。意大利比可卡大学D.Cereda发表在《生物预印本》(bioRxiv)上的一项研究报告表明,早在1号病人确诊前,病毒就已经在伦巴第大区南部很多市镇传播。通过研究伦巴第大区的5830个确诊病例,研究人员向前追溯并构建出了传播链条。结果显示,新型冠状病毒早在2020年1月1日就开始在伦巴第大区出现。

(2)进一步推测,意最早病例恐比首例报道病例提早3个月

2020年11月11日,米兰国家肿瘤研究所在《肿瘤期刊》杂志上发表的一项研究中,研究人员对2019年9月到2020年3月间招募的959名身体健康的志愿者参与一项肺癌检测的血液样本进行了新冠病毒血清检测,结果显示959份样本中有111份呈阳性,这111份阳性样本中还有6份新冠病毒中和抗体呈阳性,其中4份是2019年10月初采集的。

2020年12月8日,米兰大学的研究团队在《新发传染病》发表了一篇研究,分析了2019年9月到2020年2月期间的39份口咽拭子样本,其中一份被检测出新冠病毒核糖核酸,这份阳性样本来自一名4岁男孩。他生活在意大利米兰市附近,此前没有任何海外旅行史。病例显示,这名男孩是2019年11月21日开始出现咳嗽、鼻炎等症状的。

2021年1月7日,《英国皮肤病学杂志》刊发的一项研究结果显示,意大利米兰大学牵头的一个国际研究团队从意大利一名年轻女性皮肤病患者2019年11月10日的活检样本中,发现了新冠病毒基因序列。该患者2019年11月就诊时仅呈现出皮肤红色斑块并有轻微喉咙疼痛。2020年6月一次血清学检测发现,其血液中存在新冠病毒抗体。

(3)最新报道提示,意最早病例恐比首例报道病例提早6个月

2021年8月6日,由意大利米兰大学主导的一项研究在线发表于《柳叶刀》预印本网站(SSNR)上。该研究对2019年夏末之后保存的156例病例的435份样本进行了新冠病毒的感染调查,包括核酸检测和抗体检测。第一个新冠病毒检测呈阳性的样本是在2019年9月12日采集的尿液样本,该样本来自一名8个月大的婴儿,其血清抗体也呈阳性。这项证据表明,2019年夏末新冠已经在伦巴第地区传播了。

四、值得关注废水中检测到新冠病毒基因片段,可能从侧面反映疫情状况

多个国家在早期废水样本中检测到新冠病毒核酸。比如,2020年6月,日本学者对日本山梨县的废水和河水中存在新冠病毒基因进行了评估,在废水中发现新冠病毒的基因。从2020年6月中旬开始,法国学者在法国蒙彼利埃的主要废水处理厂的流入点检测到新冠病毒的数量增加,而该地区新的新冠患者病例数在几周后开始增加。有意思的是,意大利高等卫生研究院2020年6月18日发布的一项研究,结果显示,在意大利北部两座城市米兰和都灵2019年12月的废水样本中检测出新冠病毒核酸。西班牙巴塞罗那大学2020年6月26日发布公告称,该校领导的一个研究小组在2019年3月采集的巴塞罗那废水样本中检测出了新冠病毒,病毒水平非常低。这表明世界其他地区也可能发生了类似情况,但许多病例或因被误诊为流感而被掩盖。

新冠疫情是全人类面临的灾难,世界各国应携起手来,为找到新冠病毒的源头共同努力,为预防下一个有可能发生的疫情提供重要参考。

(作者分别系病原微生物生物安全国家重点实验室研究员;中国科学技术信息研究所助理研究员)

 
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