作者:李晨 来源: 发布时间:2020/7/31 15:55:50
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首个油菜基因转录数据库构建成功

 

 研究中所使用的油菜品种“中双11号”。油料所供图

近日,中国农业科学院油料作物研究所油料作物基因组学与抗病性改良创新团队破译了油菜基因组的全转录信息密码,构建了油菜十万余个基因的转录全景图,使得油菜基因功能研究第一次有了标准的可参考的基因转录数据库,将有力支撑油菜功能基因的相关研究。相关研究成果在线发表于《植物学报》(The Plant Journal)。

团队首席科学家刘胜毅介绍,油菜基因组包含约12亿个碱基和十余万个基因,如何解读这些海量的基因组信息成为功能基因研究的重要任务。

根据中心法则,基因通过转录形成mRNA再翻译成蛋白质。由于基因的转录通常存在多种可变的剪切方式,从而一个基因可以形成许多种不同的mRNA。此前,由于技术和资源的限制,油菜一直缺乏全基因组水平所有基因的转录mRNA数据库,导致油菜基因功能研究缺乏可查询和可参考的基因注释信息。

为了突破这一瓶颈,该团队采用最新的三代测序技术准确测定了油菜全长转录组,并自主开发了一套用于多倍体油菜复杂基因组的分型方法,绘制了油菜基因组的转录全景图,构建了油菜的标准参考转录本数据库。

该成果更新了人们对油菜基因和基因组的认识和理解,将为甘蓝型油菜功能基因和遗传改良研究及基因组设计育种提供数据基础和理论指导。

该研究得到国家重点研发计划项目、国家自然科学基金项目和中国农科院科技创新工程等项目资助。

相关论文信息:https://doi.org/10.1111/tpj.14754

 
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